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第285章 论文里掺了药(感谢nosokg的盟主!)

江河一笑,道:“别激动,慢慢说。”

冯野开始叽里咕噜。

“老大!我这段时间不是把国际上主流的分子动力学模拟软件,像aber和groacs全部研究了一遍嘛?我!发!现!他们的分布式计算架构有一个巨大缺陷,就是节点间的通信延迟太高,所以我重新写了一套pi调度逻辑,引入了马尔可夫状态模型(s)的概念,把蛋白质构象的连续变化轨迹切分了,就是说啊,咱们以后不需要让超算搞一条长轨迹,搞到昏头,慢嘟要死,是并行,并行概念!就是跑短轨迹,然后拼接起来……”

冯野越说越兴奋,专业词汇不断往外蹦。

江河其实是听不懂的。

但他微笑地听着,时不时嗯嗯两声,以作回应。

对于项目组成员激动汇报成果的时刻,他从来不缺乏耐心。

温柔的勒~

几分钟过后。

冯野终于说完了,道:“老大,大概就是这样!!!”

江河先夸:“真棒!”

简单的儿童心理学。

令冯野隔着电话都笑得合不拢嘴。

然后江河道:“来吧,用我听得懂的方式再说一遍。”

“哦哦哦!抱歉老大!”

冯野挠了挠头,道:“老大,简单来说,就是我把筛选和模拟的时长,缩短了至少……嗯,百分之九十?”

这其实说的都保守了。

单流程和并行流程比起来,效率根本不可同日而语。

针对不可成药靶点的高通量虚拟筛选,时间就是金钱。

缩短百分之九十,太牛逼了。

冯野是个天才。

但很快,他又说道:

“但是老大,哪怕缩短了这么多……kras蛋白表面的面积依然很大,我们要在整个蛋白表面寻找,呃,可能不存在的口袋,并且用几百万种小分子化合物去做分子对接模拟,这依然很耗时,咱要用超算一直跑,哪怕是租用【魔方】,可能也需要大半年的时间,才或许能找到一个有效的靶点?当然了,前提是真的有这个靶点存在……”

江河问:“如果我给你一个范围呢?”

“范围?”

“嗯,如果我在kras蛋白上给你圈定一个氨基酸坐标范围,是不是能够进一步缩短工作时间?”

“那绝对可以啊!如果有范围的话,肯定会好很多!”

“行,我今晚回去查一下文献,看看我对哪一块儿比较在意,咱们就先跑那个范围。”

“明白!我这边等您的数据!”

挂断电话。

江河回到酒店。

今天心情是真呀嘛真不错。

实际上。

江河不仅知道范围……

他其实连kras g12c突变体上隐蔽的“switch-ii”口袋的具体坐标,以及能与半胱氨酸共价结合的化合物大体结构都清楚。

前世已经被研究出来的东西了呀。

不直说,只是避免被抓去做切片研究而已……

冯野那边有这么大进展,自己这边也得加速了。

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